La parte alta del claustro conserva algunas de las pinturas más notables, sin duda elaboradas por artistas excelsos que dominaban el arte plateresco y renacentista: en las esquinas se representan pasajes de la vida de Cristo; en el lado suroeste un fragmento de la Adoración de los Pastores y la Adoración de los Reyes, al noreste sólo se salvó una representación de la Entrada de Jesús a Jerusalén.