Las razones por las cuales murió o huyó la gente de Cantona provocando con ello el deterioro y olvido de esta zona arqueológica, es que tal vez la cultura chichimeca llevó a cabo una guerra en este lugar y arrasó con todo y la otra hipótesis es que tal vez se padeció una peste o una enfermedad que obligó a la migración de quienes aquí vivieron.