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Los temas de los frescos fueron ideados seguramente por Juan de Herrera y Fray José de Sigüenza y realizados por Pellegrino Tibaldi y sus colaboradores, entre los que se encontraba Bartolomé Carducho.
En la bóveda se representan figuras femeninas representando cada una de las siete artes liberales
(astronomía, geometría, música,aritmética, dialéctica, retórica y gramática), las que componían el trivium y cuadrivium medieval.