Le temple de Baphuon était à l'origine dédié au dieu Shiva.
Construit sur un sol sablonneux, le temple a été instable tout au long de son histoire.
Dans les années 1960, un projet à grande échelle, visant à démonter le temple pour renforcer les fondations, a été mis en œuvre. 300.000 blocs ont été soigneusement étiquetés et numérotés. Malheureusement, le projet a été interrompu et abandonné pendant la guerre civile et la période des khmers rouges. En 1996 il a été repris par l'architecte Pascal Royère, le "plus grand puzzle en 3D du monde" a été achevé en 16 ans.