(Vers la fin du Moyen Âge, le sel de Guérande, l'étain de Redon et le vin muscadet attiraient les commerçants européens vers le sud de la Bretagne. Les navires qui attendaient une marée et un vent favorables pour remonter la Loire faisaient escale à Paimboeuf sur la rive sud de l'estuaire. Plus tard, en raison de l'envasement naturel, les gros navires de plus de cent cinquante tonnes ne pouvaient plus remonter jusqu'à Nantes. Les marchands nantais, ne voulant pas abandonner à d'autres ports européens leur commerce précieux avec l'Inde et les Antilles, ont décidé d’aménager Paimboeuf en bas port.
Il faut attendre le dix-huitième siècle pour que Paimboeuf remplace Nantes comme port principal de l'estuaire avant, à son tour, de céder la primauté à St-Nazaire. Pendant plus d'un siècle Paimboeuf a été une ville portuaire très riche, grâce au commerce triangulaire - le soi-disant bois d'ébène.)