(...) 1505 - 1532 - durante o governo de D. Diogo de Sousa é refeita a capela-mor com obras de João de Castilho, alteração do portal principal, com a supressão de arquivoltas e do mainel, abertura de duas amplas frestas no arco cruzeiro, uma na nave principal e uma terceira na fachada principal, ampliação dos arcos do cruzeiro, substituição das janelas da sacristia, abertura de uma porta de ligação entre a sineira e o interior da igreja e transformação da fresta da torre do relógio em janela e ligou-a ao antecoro; feitura de grades em torno da galilé, na capela-mor e nos túmulos, encerramento do espaço que viria a ser denominado Claustro de Santo Amaro, construção de um cano para escoar águas pluviais entre a Capela dos Reis e a de São Geraldo; colocação de ameias no edifício e lajeamento do templo e anexos; feitura de retábulos, colocação de azulejos e alteamento do pavimento das capelas da cabeceira; feitura das imagens da galilé, de novos túmulos de D. Henrique, D. Teresa e de Santo Ovídio; reforma da Capela de São Geraldo, com a feitura de um novo retábulo com azulejos e um altar rodeado de grades e um campanário (OLIVEIRA, 2000-2001, pp. 4-7), bem como a colocação de ladrilho no pavimento (PEREIRA, 2001, p. 12); construção de retábulo-mor em pedra de Ançã pelo mestre Machim, de origem flamenga; (...)
